Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnnm1Q0GA42 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms