Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smarcad1Q04692 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms