Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg2Q03517 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scg2Q03517 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scg2Q03517 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scg2Q03517 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scg2Q03517 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scg2Q03517 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scg2Q03517 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scg2Q03517 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Scg2Q03517 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scg2Q03517 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scg2Q03517 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scg2Q03517 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scg2Q03517 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Scg2Q03517 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scg2Q03517 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Scg2Q03517 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms