Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb4Q02738 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms