Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zfp39Q02525 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms