Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms