Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms