Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms