Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms