Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms