Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms