Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms