Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms