Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms