Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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