Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Arf1P84078 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Arf1P84078 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Arf1P84078 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Arf1P84078 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Arf1P84078 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Arf1P84078 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms