Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms