Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx2P80206 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx2P80206 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx2P80206 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx2P80206 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Otx2P80206 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms