Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Tp53bp1P70399 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Tp53bp1P70399 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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