Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snrpd1P62315 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snrpd1P62315 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snrpd1P62315 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Snrpd1P62315 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Snrpd1P62315 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Snrpd1P62315 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Snrpd1P62315 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Snrpd1P62315 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Snrpd1P62315 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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