Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms