Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2kP61087 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms