Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2mP61082 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms