Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm2P58774 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm2P58774 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms