Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P58686 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P58686 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P58686 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P58686 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P58686 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P58686 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P58686 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P58686 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P58686 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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P58686 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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P58686 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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P58686 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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P58686 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P58686 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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