Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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