Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NcstnP57716 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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NcstnP57716 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcstnP57716 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcstnP57716 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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NcstnP57716 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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NcstnP57716 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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NcstnP57716 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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NcstnP57716 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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NcstnP57716 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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NcstnP57716 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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NcstnP57716 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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NcstnP57716 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcstnP57716 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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