Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp25P57080 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp25P57080 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp25P57080 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp25P57080 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp25P57080 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp25P57080 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp25P57080 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp25P57080 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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