Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Cldn18P56857 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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