Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Irf5P56477 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Irf5P56477 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Irf5P56477 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Irf5P56477 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Irf5P56477 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Irf5P56477 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Irf5P56477 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Irf5P56477 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Irf5P56477 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Irf5P56477 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Irf5P56477 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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