Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacnb3P54285 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms