Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms