Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms