Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sept1P42209 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms