Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtbP41155 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LtbP41155 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LtbP41155 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LtbP41155 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LtbP41155 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtbP41155 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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