Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VhlP40338 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VhlP40338 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VhlP40338 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VhlP40338 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
VhlP40338 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
VhlP40338 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
VhlP40338 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
VhlP40338 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VhlP40338 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
VhlP40338 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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