Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tjp1P39447 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms