Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddit3P35639 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms