Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usp4P35123 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usp4P35123 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usp4P35123 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usp4P35123 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usp4P35123 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usp4P35123 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usp4P35123 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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