Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms