Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms