Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms