Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx2P30658 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms