Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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