Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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