Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxrgP28705 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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