Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa3P28310 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa3P28310 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa3P28310 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms