Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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