Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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