Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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